植物根系分析系统对于根系的分析能够十分准确可靠，对于其存活数量可以确定出来，输出不同颜色根系的直径、长度、投影面积、表面积、体积；能进行根系的拓扑分析，自动确定根的连接数、关系角等，可单独自动分析主根或任意一支侧根的长度和分叉数等；自动分析根系分级伸展的等级分布情况，可达到5级侧根的自动分析；可单独显示标记根系的任意直径段相应各参数（分档数、档直径范围任意可改）；能用盒维数法自动测根系分形维数。
　　
　　大批量的全自动根系分析，植物根系分析系统可对各自动分析结果图进行编辑修正；能进行根的分叉裁剪、合并、连接等修正，修正操作能回退，以快速获得99%正确的结果。精度：根长≤±1%；面积：优质图像质量时<1%，标准图像质量时≤3%；匹配专门的双光源照明系统，提供高分辨率的彩色或黑白图像，去除了阴影和不均匀现象的影响，有效保证图像质量；采用非统计学方法测量计算出交叉重叠部分根系长度等，可保存或读取TIFF、BMP、PNG、JPEG、PCX标准格式的图像。可兼做针叶面积、体积测量，以及棉纤维粗细、长度测量。
　　
　　植物根系分析系统可人工辅助修正：图像可放大缩小和局部观察，可实现鼠标区域选择统计、对污染区的辅助裁剪或橡皮擦修正。统计效果监视：监视和修正植物对象分析的精度。自动杂质剔除：根据尺寸等方面的区别，进行自动杂质剔除。辅助测量功能：可数据导出：分析图像、分布图、结果数据可保存，分析结果输出至Excel表，可输出分析标记图；尺寸标定：自带标定功能，实现半自动的尺寸标定，XY向可分别标定修正；长度测量：具有跟随放大镜功能，通过鼠标拖动精确测量。