根系图像分析仪是一款现代植物生理研究的重要仪器，主要用于研究作物根系拓扑结构。通过该仪器，工作人员可以快速完成的根系的节点、长度等多个参数测量的工作，大大简化了工作人员的测量工作，提升了工作效率，工作准确度。因此，该根系图像分析仪一上市就广受农业科研教学机构喜爱。例如，就有学者使用根系图像分析仪等仪器对水稻表层根系图像分割算法研究。具体如下：

    水稻根系形态特征的定量研究对于改进农田管理方式、水稻品种选育和遗传改良等具有重要意义。近年来，随着表型组技术迅速发展，利用图像处理技术对水稻根系生长情况进行测量和分析，同时配合施肥、灌溉、光照、温控等环境监控技术已成为水稻育种和功能基因组研究新型技术手段，而根系图像分割技术是进行后续表型组学分析的重要基础之一。由于生长在土壤中的水稻根系图像具有对比度低、信噪比低、纹理复杂的特点，分割十分困难。针对此问题，研究了主干-分支连接算法、基于形态特征的局部阈值分割算法和基于形态特征的自适应阈值分割算法，对生长在土壤中水稻根系图像进行分割处理和比较。

    实验结果表明，主干-分支连接算法虽然保留了大量细节，但是受噪声影响严重，其结构略显杂乱，毛刺现象严重；基于形态特征的局部阈值分割算法能保留更多根部的细节，但轮廓断裂的现象比较严重；自适应阈值分割算法分割的图像根系连续性较好，毛刺现象也得到了抑制，但是细小的须根无法保留。最终将两种算法结合起来，提出一种适用于水稻表层根系图像分割的综合算法，则可以获得较为理想的分割结果，为后续水稻根系性状提取奠定了重要基础。