根系分析系统可以快速的识别植物根系的多项数据并展现在屏幕上，因此根系分析系统是现代农业、植物研究中的重要工具之一。我们知道的植物根系的健康状态度作物的整体生长状态都有着较大的影响。这是由于根系是植物吸收水分、养分的重要器官。当根系出现问题时，植物不能正常吸收水分、养分，就会导致的停止生长，甚至会慢慢死亡。为了更加深入的了解植物根系的影响，人们通过根系分析系统等仪器进行的多种研究。下面就是学者利用根系分析系统对连作棉田轮作苜蓿、小麦后对棉花光合能力和根系生长的影响的研究。

    新疆棉花连作现象普遍，连作障碍严重，通过轮作调节农田生态环境、缓解棉花连作障碍对实现新疆棉花生产的可持续发展具有重要意义。基于棉花长期连作30年棉田土壤，设置连作棉花(CK)、轮作苜蓿2年后种植棉花(AC)及轮作小麦2年后种植棉花(WC)3个处理的根箱试验，研究这2种轮作模式对连作棉花地下部根系发育与地上部植株生长及叶片光合能力的影响，揭示轮作对连作棉花障碍的改善效果。

    结果表明，与对照相比，轮作小麦、苜蓿处理的棉花根长、根干质量和比表面积增加(增幅为6.90%～43.30%)，且WC处理的增幅大于AC处理。根系条件的改善促进了地上部植株的生长与叶片光合能力。与对照相比，轮作小麦、苜蓿后棉花的叶绿素含量、净光合速率和单株质量增加(增幅为4.83%～40.49%)，且WC处理的增幅大于AC处理。在新疆长期连作棉田轮作小麦和苜蓿，可发挥轮作增加植物多样性、改良土壤生态环境的效果，促进棉花根系发育，提高棉花叶片光合生产能力和生物量。轮作小麦对棉花生长的促进效果优于轮作苜蓿，可作为当地缓解棉花连作障碍的较佳种植方式。